受其它藻種的生長制約，藍藻并不可能在常溫條件下大規模暴發，水溫25—35℃時，藍藻的生長速度才會比-藻類快，故溫度是藍藻暴發
受其它藻種的生長制約，藍藻并不可能在常溫條件下大規模暴發，水溫25—35℃時，藍藻的生長速度才會比-藻類快，故溫度是藍藻暴發的主要因素之一。養殖水體中富營養化，藍藻比較容易生長，所以不經常換水的池塘往往更容易暴發藍藻。有機磷是藍藻生長的必須因素，治理藍藻最直接根本的辦法就是除去有機磷。
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藍藻治理貴在預防
最有效的肯定是做好預防，不讓藍藻爆發。具體預防措施主要有以下幾點：1.早期魚塘中投放適量的濾食性魚類如花白鰱可以破壞藍藻，一定程度上可以預防藍藻爆發。2.定期噴含有枯草芽孢桿菌的水產EM菌。欣圣源水產EM菌包含枯草芽孢桿菌、光合細菌等可以分解水體中的有機質，減輕水體的富營養化，還能調節水體pH值、調節水質。3.定期補肥補菌。配合枯草芽孢桿菌的噴施，還要定期補肥，促進優質藻類繁殖，抑制藍藻爆發。4.在水產養殖的第二個月開始，要注意加強底質改良，調節水質。藍藻易發時期，定期進行水質檢測，監控水體中藻類含量。
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在天氣變化，如大風或下雨等時，水體會發生垂直流轉，把底層高有機質的水交換起來，引起藍藻大量繁殖。導致大部分養殖水體，在天氣變化后會爆發藍藻。同時，池塘注入富含N、P的水（如生活污水）
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